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要取消农业银行卡的短信提示功能并设置密码，可以按照以下步骤操作。
1、网上银行操作：
登录农业银行网上银行。
进入“客户服务”栏目，选择“消息服务”。
点击“注销”以取消短信通知，可以在该界面设置新的密码。
2、柜台办理：
携带有效身份证件和银行卡前往农业银行网点。
告知工作人员需要取消短信通知服务并设置密码。
填写相关申请表格，进行身份验证后，即可取消短信提示功能并设置密码。
3、电话客服：拨打农业银行客服热线95599，根据提示进行自助取消短信通知服务，也可要求客服帮助进行密码重置。
不同情况下具体操作可能会有所不同，如有特殊情况或需要进一步帮助，可以咨询农业银行客服人员获取详细指导。